Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms