Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CA9Q16790 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CA9Q16790 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CA9Q16790 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CA9Q16790 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CA9Q16790 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CA9Q16790 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CA9Q16790 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CA9Q16790 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms