Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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