Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LY6EQ16553 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LY6EQ16553 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LY6EQ16553 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LY6EQ16553 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LY6EQ16553 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LY6EQ16553 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LY6EQ16553 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LY6EQ16553 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LY6EQ16553 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms