Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RPE65Q16518 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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