Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA6Q16445 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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