Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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