Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD2Q16342 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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