Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms