Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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