Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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RAB39AQ14964 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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