Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCD11Q14690 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD11Q14690 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms