Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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COL4A6Q14031 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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COL4A6Q14031 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL4A6Q14031 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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