Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms