Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1CQ13936 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms