Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms