Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL1Q13616 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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