Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR3Q13615 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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