Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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