Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms