Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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