Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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RPA4Q13156 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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RPA4Q13156 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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RPA4Q13156 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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RPA4Q13156 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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