Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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CALCOCO2Q13137 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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