Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD4Q12950 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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