Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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