Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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