Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIAQ12857 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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