Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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