Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFEMP1Q12805 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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