Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC173Q0VFZ6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms