Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4DQ08499 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms