Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms