Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms