Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms