Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms