Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms