Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms