Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms