Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms