Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BDH1Q02338 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BDH1Q02338 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BDH1Q02338 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BDH1Q02338 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BDH1Q02338 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms