Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms