Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms