Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms