Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms