Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms