Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms