Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms