Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms