Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms