Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP1P63208 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP1P63208 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP1P63208 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms